回想过去几年的经历,那个看不见的敌人——新冠病毒,之所以能快速传播、疯狂复制,不仅因为它 “勤奋”,更因为它足够 “聪明”:会偷偷改造人体细胞的 “生产线”,为自身繁殖铺路。近日,发表在《Nature Communications》的一项研究,揭开了冠状病毒的狡猾策略:来自西班牙庞培法布拉大学等机构的科学家发现,无论是致病性强的新冠病毒(SARS-CoV-2),还是仅引发普通感冒的 HCoV-OC43,都会通过重编程转运 RNA(tRNA)的表观转录组,改写细胞的蛋白合成规则,让宿主细胞全力为自己生产病毒蛋白。


这项研究的核心,聚焦于细胞里负责搬运氨基酸、组装蛋白质的 “小工人”——tRNA。我们知道,基因密码存在冗余性,一种氨基酸可由多种同义密码子编码,而细胞会根据 tRNA 的丰度偏好使用特定密码子。有趣的是,冠状病毒的基因组中,富含 A/U 结尾的 “次优密码子”——这些密码子对应的 tRNA 在正常细胞中数量稀少,按理说会拖慢蛋白合成速度,但病毒却能反其道而行之,实现高效复制。


图片


秘密就藏在 tRNA 的 “化学修饰” 上。tRNA 上的化学修饰(即表观转录组)能改变其解码密码子的能力,就像给 “小工人” 升级装备,让它们能处理原本不擅长的 “工作”。研究发现,冠状病毒感染细胞后,会触发 DNA 损伤和氧化应激反应——这种细胞的 “危机状态” 本是为了启动应急防御,但病毒却趁机 “趁火打劫”,利用应激反应诱导的 tRNA 修饰重编程,让细胞的蛋白合成系统 “为己所用”。


具体来说,病毒会靶向调控四种关键的 tRNA 修饰:肌苷(I)、Queuosine(Q)、5 - 甲基羧甲基尿苷 / 5-甲基羧甲基-2-硫尿苷(mcm5U/mcm5s2U)以及 5-甲基胞苷/5-甲酰胞苷(m5C/f5C)。这四种修饰能精准解码冠状病毒基因组中富集的 A/U 结尾密码子:比如mcm5U/mcm5s2U修饰会增强对 Arg-AGA、Lys-AAA 等 A 结尾密码子的识别,Q 修饰则助力 Asn-AAU、Asp-GAU 等 U 结尾密码子的解码,而 I 修饰的下调会减少对病毒次优密码子的竞争,间接提升病毒蛋白合成效率。


更关键的是,这种重编程是通过调控 tRNA 修饰酶的表达实现的。研究发现,病毒感染后,负责mcm5U/mcm5s2U修饰的 KIAA1456、ALKBH8 酶,以及负责 Q 修饰的 QTRT1/QTRT2 复合物表达会上调,而负责 I 修饰的 ADAT2 酶、负责f5C修饰的 ALKBH1 酶表达会下调。这种酶类表达的动态变化,直接导致了 tRNA 修饰谱的改变,比如新冠病毒和 HCoV-OC43 感染后,都会出现mcm5U修饰升高、I/f5C修饰降低的特征,且这一现象在感染新冠病毒的叙利亚仓鼠肺部组织中也得到了验证。


值得注意的是,两种冠状病毒的重编程策略既有共性也有差异:两者都会下调 I 修饰、上调mcm5U修饰,但只有 HCoV-OC43 会显著上调 Q 修饰——可能与低致病性冠状病毒更依赖 Q 修饰解码特定 U 结尾密码子有关。而通过 mim-tRNAseq 技术分析发现,病毒对 tRNA 的改造主要是修饰已有分子,而非改变 tRNA 的整体丰度,这种 “精准改造” 能让病毒快速适配细胞的蛋白合成系统,避免引发过度的免疫警觉。


为了验证这一机制的关键作用,研究人员通过 siRNA 沉默关键修饰酶(如mcm5U通路的 ELP3、Q 通路的 QTRT1),或过表达抑制性修饰酶(如 I 通路的 ADAT2、f5C通路的 ALKBH1),结果发现病毒蛋白的产量大幅下降。这表明,这些 tRNA 修饰酶是冠状病毒复制的 “通用命门”——无论病毒变异出何种毒株,只要依赖 A/U 结尾密码子的特征不变,就离不开对这些修饰通路的调控。


这项研究还揭示了一个更普遍的病毒生存策略:许多 RNA 病毒的基因组都富含 A/U 结尾密码子,它们都会利用宿主的应激反应重编程 tRNA 修饰,让 “次优密码子” 变成 “最优密码子”,从而高效表达病毒蛋白。而冠状病毒的独特之处在于,其 U 结尾密码子的占比异常高,对 I 和 Q 修饰的依赖也更为显著,这也解释了为何两种致病性差异巨大的冠状病毒,会共享这一核心复制机制。


回顾过去二十多年,从 SARS、MERS 到新冠,冠状病毒三次跨物种传播,其可怕之处不仅在于致病性,更在于善于利用宿主细胞的资源。而这项研究的意义,不仅在于看清了病毒的 “偷工减料” 骗局——不自己搭建生产线,而是通过改造 tRNA 修饰 “借鸡生蛋”,更找到了冠状病毒家族的通用弱点。未来,若能开发出靶向这些 tRNA 修饰酶的药物,就能从源头阻断病毒的蛋白合成,为应对新型冠状病毒提供广谱、高效的抗病毒策略,避免下一场大流行的发生。


人类与病毒的微观较量从未停止,而这项研究让我们在看清敌人狡猾本质的同时,也握住了更精准的 “反击武器”。正如研究者所言,病毒的优势在于借力打力,而我们只要堵住它的 “借力之路”,就能让它的复制速度彻底慢下来。


参考文献:

Muscolino, E., Puig-Torrents, M., Buigues Bisquert, J. et al. Coronaviruses reprogram the tRNA epitranscriptome to favor viral protein expression. Nat Commun (2026). doi:10.1038/s41467-026-69700-w.


图片