近日,光明网在“网络强国·百人谈”栏目“未来已来”系列观察中专访了清华大学生命科学学院教授、合成与系统生物学中心主任陈国强,双方围绕生物制造这一新质生产力的概念、应用、优势等多领域展开讨论。

下文中我们重点关注到其中涉及AI应用的部分,与读者交流分享。

记者:近年来,人工智能技术快速发展,与生物制造领域的融合日益加深。人工智能应用能带来哪些助益?


陈国强:就我所关注的生物催化剂“酶”而言,从自然界筛选出的酶,存在活性低、对不同材料相容性差、催化特异性窄等问题,自然界也没有进化出适配特殊材料合成的酶。


虽然可以通过加速进化的方法获取所需酶,但AI能实现酶的从头设计或在现有酶的基础上进行重新设计,快速创造出自然界不存在、或性能更优的酶。


天津工业生物所开发全新酶功能注释AI工具ECRECer----中国科学院天津工业生物技术研究所


传统的进化突变法不仅耗时久,还未必能得到高特异性、高活性的酶。AI工具能让酶的设计速度实现跨数量级提升。未来,自然界中稀缺或不存在的酶,或许有很多能通过AI设计获得。


当需要某类功能的酶时,我们先梳理自然界中已知酶的DNA序列或氨基酸序列,让AI学习数据库中大量酶的DNA序列、氨基酸序列数据,AI会根据催化反应需求,寻找或设计出多种序列排列组合方式,随后科研人员在实验室将设计出的序列合成为DNA,利用细菌细胞验证AI设计的酶是否能催化目标所需的特殊反应。


如果由科研人员手动研究酶的数万个序列,时间往往按年来计,而AI仅需数天就能完成。


除了酶,AI还能类似地应用于代谢路径的设计。AI通过快速检索已发表文献中的产物代谢路径和产率数据,进行排列组合后,为科研人员快速推荐产量最大化的代谢路径组合方案。如果由科研人员手动检索文献并筛选方案,不仅耗时极长,还容易遗漏关键信息。


记者:从事生物制造相关工作的人才,需要具备哪些能力和素养?对该领域人才培养有什么建议?


陈国强:生物制造领域的人才需要具备跨学科的知识背景。其中,微生物学是核心,还需要酶相关的知识,分子生物学是另一个支撑学科,这三大方向构成了生物制造的核心知识体系。


擎科AI平台破解酶工程难题,助力产业升级_双语频道_新闻中心_长江网_cjn.cn


此外,合成生物学作为新兴的跨学科领域,整合了生物制造的分子操作、微生物优化等工作。未来,人工智能(AI)也将深度融入生物制造,AI能设计催化范围更广的酶、转化率更高的代谢路径,推动生物制造向更高水平发展。


总体而言,生物制造人才需要掌握微生物学、分子生物学、化工、AI等领域的知识,部分工作还会涉及机械制造、动力学等学科,具备多学科背景的人才更适配产业发展需求。


因此,需在生物制造人才培养体系中加入AI相关专业内容,高校和科研机构还可推动跨学科融合,比如,科研人员跨院系兼职,促进不同学科知识的融合,培养具备多学科背景的人才。


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