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特朗普政府削减科研经费下,已经严重波及到AI生命科学。

 

根据Science报道,著名的CASP比赛结构预测的关键评)将因为NIH经费不足而停办。

 

要知道,AlphaFold2就是在CASP14上一举成名,以近乎实验室的精度实现对蛋白质三维结构的精准预测碾压所有对手,解决困扰生命科学60年的难题。

 

就在该比赛4年后,AlphaFold2以重磅级成果获得了2024年诺贝尔化学奖,足以见得其对行业的深远意义。

 

可以说CASP促进并见证了AI+生命科学的里程碑式突破。

 

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202年诺贝尔化学奖得主


CASP极大程度地推动了AI+生命科学的进展。然而,这项举办了30年的计算生物学却面临着停办危机。

 

据报道,来自美国NIH美国国立卫生研究院的资金已经用完并将在 8 日耗尽负责监督该赠款的加州大学 戴维斯分校的紧急支持。

 

或许,我们将等不到CASP17了。

 

AI生命科学推动者

 

CASP全称为Critical Assessment of Protein Structure Prediction,意为蛋白质结构预测的关键评估。

 

该赛事始于1994年,当时计算生物学开始在学界兴起,但所有团队都声称自己的蛋白质折叠算法最优,各家都能给出自己的理由。

 

大家意见不统一,是骡子是马,不如拉出来溜溜?

 

于是,为了帮助学界建立一个客观、统一的评估标准,科学家John Moult及其伙伴创办了CASP比赛。

 

它通过盲测和独立评估的方式,逐渐成为了评估蛋白质结构预测技术准确性的“黄金标准”。

 

比赛中,参赛者们预测的是一些结构尚未公开的蛋白质,同时以独立评估的方式,将其和实验室结果进行严格的评分。

 

其公正性得到了学界的一致认可,因此当AlphaFold2经验亮相CASP14时,虽然震惊了学界,但科学家依然相信其评估结果。

 

如今,该赛事已经发展成全球性的、两年一度结构预测比赛,每年有数百个团队参与,被誉为AI生命科学界的“奥林匹克”

 

中国也有不少团队拿下过好成绩,CASP15中拿下多个第一。常规target(单体蛋白)预测类别中,山东大学杨建益团队排名第一;RNA结构预测类别中,中国公司智峪生科居榜首;蛋白质-配体复合物预测类别中,江苏理工大学常珊博士团队位列第一;蛋白质复合物界面接触残基精度评估类别中,浙江工业大学张贵军团队排名第一。

 

可以说,CASP对于AI 生命科学的意义是革命性的。它不仅驱动 AI 在生物学领域的应用,也促进了AI在整个药物研发的应用。

 

甚至因AlphaFold2获得诺贝尔奖的Demis Hassabis称,也许就在未来十年左右,我们也许能治愈所有疾病。


没有人想停下AI+生命科学的脚步。

 

无奈停办?

 

尽管CASP见证了AlphaFold2这一诺贝尔奖成果,但一项诺奖成果只是AI+生命科学的开始。

 

因为AlphAFold2只解决了单体蛋白质结构预测,CASP已经开始将目光投向更复杂的挑战,如RNA结构预测、蛋白质-配体相互作用、蛋白质动力学等。

 

如今的CASP已经远远超过其最初的规模,不仅项目一再拓展,同时不仅局限于科研,和产业界有了更多的联系。

 

例如,CASP新增一项比赛项目中是确定药物分子如何与蛋白质靶标结合,这是发现新药的关键。如果停办,这些更前沿、更复杂的领域的评估和推动将面临困难。

 

然而现实是,不止是CASP比赛,很多科学家因为NIH经费削减连生存都处了问题。

 

特朗普上台后,白宫计划在2026年将美国医疗健康支出费用削减四分之一以上,并将NIH的预算在今年的基础上减少180亿美元至270亿美元,降幅达40%

 

由于经费大幅度削减,导致NIH开启彻底重组,据称,已有近5000NIH员工和承包商已被解雇,数千项研究与实验陷入停滞状态。

 

今年2月,白宫还宣布要求将NIH间接经费削减至预算的15%,引发了强烈的不满。

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学界严厉地指出:特朗普政府的科研经费削减行动动摇了自第二次世界大战以来美国联邦政府资助大学科学研究的制度基础。

 

CASP 的停摆可能会在一定程度上削弱其作为AI驱动生物学进步的催化剂作用。

 

因为CASP 是唯一一个全球性的、独立评估蛋白质结构预测方法准确性的比赛。如果停办,研究人员将缺乏一个客观、权威的平台来比较和验证新的方法。

 

不仅项目本身需要资助,还包括加州大学戴维斯分校的赠款用于协调大批科学志愿者,包括实验小组、建模小组、评估员等。

 

组织者仍然希望 CASP 能够得到资助主办方表示,如果 NIH 或其他资助者没有通过,加州大学戴维斯分校目前正在探索是否有能力存档 CASP 的计算机服务器。这样,竞争对手几十年的资源就不会丢失。


科学家们纷纷痛惜,希望有人能够继续资助这项赛事。


有人表示,谷歌或者Google DeepMind应该资助这项赛事,因为它们有充足的资源。

 

但是,即使资金真的到账,也不能保证在运行该计划的人离开并且科学志愿者网络解散后,CASP 的成功会持续下去。

 

 

—The End—

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