合成生物学可谓近年来发展最为迅猛的新兴前沿交叉学科之一。
作为一项综合了科学与工程的崭新的生物技术,合成生物学借助生命体高效的代谢系统,通过基因编辑技术改造生命体以设计合成,使得在生物体内定向、高效组装物质和材料逐步成为可能,该技术应用于生物材料、生物燃料、生物医药等多个领域。
生物合成法通常通过对现有生物系统的改造,或者从头人工合成基因组并重构生命体的方式来得到新的代谢途径,并通过这个新的代谢途径来得到新的代谢产物。从理论上看,通过生物合成技术可以合成绝大多俗化合物,甚至还可以合成传统化工法不能合成的新材料。在医疗领域,这项技术被用于获得医药原材料、催化剂、中间体等。
通过重新设计和构建生物系统,合成生物学不仅在理论上拓展了人们对生命本质的理解,更在实际应用中展现出巨大的潜力和价值。
当前,合成生物学的核心在于对生物组件的精确控制和优化,这要求高度的技术创新和跨学科的合作。行业内部的竞争日益激烈,企业纷纷投入巨资进行研发,以期在这一新兴领域占据一席之地。全球市场对合成生物学产品的需求持续增长,预计未来几年将见证该行业的爆炸性增长。
在这样的大背景下,一些公司凭借其前瞻性的技术视野和创新能力在行业中崭露头角。Asimov公司便是其中的佼佼者。这家合成生物学前沿企业,通过其独特的基因线路设计平台,正在重新定义活细胞的编程方式。
革新全栈式生物设计工具,
三轮融资斩获超2亿美元
在波士顿这座科技创新的摇篮中,Asimov公司如同一颗孕育着无限可能的种子。Asimov的诞生,并非一蹴而就,而是源于一群多学科背景的科学家、工程师和设计师的共同愿景。
2017年,Chris Voigt 、 Doug Densmore 、 Alec Nielsen 和 Raja Srinivas 联合创立了 Asimov,Alec Nielsen担任公司的首席执行官。
此前,Chris Voigt(麻省理工学院)和Doug Densmore(波士顿大学)已有多年的合作关系,两人致力于建立遗传逻辑电路设计的基础,为活细胞编程。
后来,Alec Nielsen作为博士生加入了Voigt实验室。Alec Nielsen是Asimov的联合创始人兼首席执行官,更是合成生物学领域的杰出科学家。Nielsen博士以其在电气工程、生物工程以及合成生物学的深厚背景,引领公司在可扩展生物化学、细胞功能设计以及基因设计和生物安全中的机器学习应用方面不断突破。
2016年,三人和NIST(国家标准技术研究所)的合作者发布了Cello——一个遗传电路设计自动化的平台,相关研究以题“Genetic circuit design automation”发表于 Science 。
Cello平台将生物电路的设计类比于电子产品中集成电路的设计,应用电子设计自动化(EDA)的原理来增加电路的复杂性,从而加速遗传电路设计。
Asimov的平台正是基于与Cello相同的设计理念。Alec Nielsen表示,工程药物领域发展迅速,但设计和制造这些药物的技术并没有跟上。他曾引用美国FDA前局长Scott Gottlieb的发言表达这一理念,“对于普通药物来说,80%的复杂性在于临床测试;而对于细胞和基因疗法,情况正好相反,80%的复杂性在于制造。”
Asimov旨在打破药物发现的瓶颈,开发更好的生物学设计工具。基于这个理念,Asimov开发了一款用于对活细胞进行编程的全栈基因线路设计平台,通过整合哺乳动物合成生物学、计算机辅助设计和机器学习,旨在为活细胞编程提供全面而精细的工具,从而推进生物制剂和基因疗法的设计和制造。
换言之,Asimov的技术能够在计算机上预测遗传系统,使用Kernel平台来调整基因回路,然后通过实验测试最佳组合。
该平台结合了合成生物学、生物物理模拟和基于机器学习的设计,经过设计的基因线路能应用在生物技术的各个领域,让客户能够优化遗传逻辑门的设计和构建,以及开发先进的制造和医疗应用。
随着公司技术的不断发展和成熟,Asimov吸引了资本市场的目光。2017年12月,Andreessen Horowitz领投的500万美元种子轮融资为公司注入了第一股活力。随后,Horizons Ventures在2020年1月注入了2500万美元的A轮融资,为公司的快速成长提供了动力。
到了2023年1月,公司完成了1.75亿美元的B轮融资,计划利用这笔资金扩大其在生物制剂、细胞/基因疗法和RNA方面的工具和服务业务。此次融资不仅表示了行业对Asimov技术实力的认可,也是对其未来发展的坚定信心。

可设计、可模拟、可分析,为编程活细胞提供全面解决方案
Asimov的产品Asimov Platform,是一个集成了细胞、基因和软件的系统,为编程活细胞提供了全面的解决方案。
首先,该平台通过其经过工程改造、高度表征的GMP宿主细胞,为生产治疗药物提供了坚实的基础,并附有支持性监管文件。
同时,其庞大的基因片段库,包含数以千计经过验证的遗传组件,可控制细胞生物学,包括转座酶整合、表达载体、诱导系统、组织特异性启动子等,为设计新系统提供了丰富的工具箱。
Asimov Platform的设计软件基于云技术,允许用户为特定应用设计、模拟和优化不同细胞类型的遗传系统。其多组学分析可实现细胞系的高级QC,加深生物学理解,并为遗传设计提炼可操作的见解。
最后,该平台的技术指南由公司科学家和合成生物学团队开发,针对平台的各个方面进行了优化和验证,确保实验的可重复性和效率。
在工作流程方面,Asimov平台分四个流程。一是设计(Design):在整个生命之树中,大自然已经以基因和遗传部分的形式进化出数十亿个有用的分子装置。Asimov采购、编目、表征、改进和重新混合这些组件,为公司的合作伙伴提供一个大型工具箱来设计新系统。
二是模拟(Simulate):生物学极其复杂,基因工程开启了无限的设计空间。Asimov提供数据驱动的计算模型来预测遗传系统的行为方式。Asimov的目标是推动生物技术超越反复试验。
三是优化(Optimize):人工智能工具正变得越来越成为蜂窝系统工程的核心。Asimov使用机器学习将大规模数据集与生物学机制模型联系起来,从而实现遗传系统的算法优化。
最后是分析(Analyze):基因组规模的多组学测量技术提供了对细胞的深入观察。这些技术允许在整个细胞的规模上进行通路分析,并以单核苷酸分辨率进行检查。
与超25家公司合作,
在中国计划向粤港澳大湾区扩展
从“试错”到“设计”,合成生物学探索走向“定量”阶段